近日，德州學(xué)院山東省生物物理重點實驗室王吉華教授帶領(lǐng)團隊，在國際頂級期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)發(fā)表論文，題為“一個升級版的低通量實驗驗證功能性長非編碼RNA數(shù)據(jù)庫EVLncRNAs 2.0” (EVLncRNAs 2.0: an updated database of manually curated functional long non-coding RNAs validated by low-throughput experiments) 。該研究創(chuàng)建了一個升級版實驗驗證綜合長非編碼RNA數(shù)據(jù)庫，包含了124個物種、1082種疾病等相關(guān)的4010個實驗證實的功能性長非編碼RNA，并研究了長非編碼RNA的物種分布、與癌癥和其他疾病的關(guān)系，以及與其他生物大分子的相互作用信息等，對長非編碼RNA特征提取、預(yù)測器發(fā)展和新功能認識具有重要意義。

王吉華教授為該論文通訊作者。第一作者是青年教師周百靈博士，季保華副教授為文章并列第一作者。澳大利亞格里菲斯大學(xué)周耀旗教授是共同通訊作者。

長非編碼RNA是當(dāng)前生命科學(xué)前沿研究熱點，在表觀遺傳調(diào)控、細胞周期調(diào)控和細胞分化調(diào)控等眾多生命活動中發(fā)揮重要作用，具有重要的生物功能，與癌癥、老年癡呆、自閉癥等人類許多重要疾病的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)，對生命過程和疾病的機理研究至關(guān)重要，對疾病新的生物標記物和藥物靶點的發(fā)現(xiàn)具有重要實際意義。

功能性長非編碼RNA數(shù)據(jù)庫是全面深入開展長非編碼RNA研究的重要基礎(chǔ)。王吉華教授帶領(lǐng)團隊于2018年在該期刊發(fā)表了實驗驗證綜合長非編碼RNA數(shù)據(jù)庫EVLncRNAs 1.0。自EVLncRNAs 1.0發(fā)表以來，已被中國、美國、德國、英國、法國、意大利、澳大利亞、巴西、日本、韓國等60多個國家的研究工作者訪問了10000多次，論文被國際權(quán)威期刊引用40多次，EVLncRNAs被美國科學(xué)家Bandrowski和法國科學(xué)家Arnaud Desfeux建設(shè)的組學(xué)航母在線收錄。

EVLncRNAs 2.0是EVLncRNAs 1.0數(shù)據(jù)庫的升級版。王吉華教授組織了三十多人組成的研究團隊，經(jīng)過三年多潛心研究，與國內(nèi)外學(xué)者合作，綜合運用多種手段持續(xù)不斷挖掘功能性長非編碼RNA，并對長非編碼RNA的新特征、新功能等進行分析研究，不斷豐富和發(fā)展數(shù)據(jù)庫的內(nèi)容、功能和各種信息并最終完成。

該綜合數(shù)據(jù)庫收錄了來源于124個物種的4010個長非編碼RNA，并提供了每個長非編碼RNA的基本信息、功能信息、相關(guān)疾病信息、與其他生物大分子的相互作用信息等，還新提供了結(jié)構(gòu)信息、編碼小肽的信息、外泌體相關(guān)信息、環(huán)形RNA信息和對藥物、化學(xué)物質(zhì)等的抗性信息，構(gòu)建了長非編碼RNA與其他生物大分子、疾病的交互式相互作用網(wǎng)絡(luò)。這些全面可靠的數(shù)據(jù)信息，對長非編碼RNA特征提取、預(yù)測方法發(fā)展和新功能認識，乃至重大疾病和精準醫(yī)療的研究具有重要意義。

生物物理省重點實驗室扈國棟、王菲、陳清帥、劉奎、于茹、黃平平、任景等青年教師以及中山大學(xué)楊躍東教授、趙慧英研究員也參與了相關(guān)研究工作。該研究成果得到了國家自然科學(xué)基金項目等多項課題的資助。

EVLncRNAs 2.0數(shù)據(jù)庫界面

（通訊員：馬曉敏）